Des recherches récentes ont découvert des variantes génétiques associées au risque de maladie d'Alzheimer, en utilisant le séquençage du génome entier pour fournir de nouvelles informations sur les voies de traitement potentielles. Cette étude met en valeur l’importance de la diversité dans la recherche génétique et vise à explorer davantage ces variantes dans des études futures.
Une étude récente a utilisé le séquençage du génome entier pour identifier avec précision des gènes particuliers et des altérations génétiques dans des régions précédemment liées à Alzheimer maladie, visant à guider le développement d’approches de traitement et de prévention à venir.
La découverte de variantes génétiques qui contribuent à la probabilité de développer la maladie d'Alzheimer est essentielle pour faire progresser notre compréhension de la manière de gérer cette maladie neurodégénérative incurable. Une étude collaborative entre la Boston University School of Public Health (BUSPH) et la UTHealth Houston School of Public Health a identifié plusieurs variantes génétiques qui pourraient affecter le risque de maladie d'Alzheimer, rapprochant ainsi les scientifiques de l'identification de mécanismes biologiques qui pourraient être ciblés dans le développement de traitements et stratégies préventives.
Publié dans la revue Alzheimer et démence : le journal de l'Association Alzheimer, l'étude a utilisé le séquençage du génome entier et a identifié 17 variantes significatives associées à la maladie d'Alzheimer dans cinq régions génomiques. Ces données permettent aux chercheurs d'identifier des gènes et des variantes rares et importants, en s'appuyant sur des études d'association à l'échelle du génome, qui se concentrent uniquement sur les variantes et les régions communes.
Les résultats soulignent la valeur des données de séquençage du génome entier pour obtenir un aperçu longtemps recherché des causes ultimes et des facteurs de risque de la maladie d'Alzheimer, qui est la cinquième cause de décès chez les personnes de 65 ans et plus aux États-Unis. En tant que forme de démence la plus courante, la maladie d'Alzheimer touche actuellement plus de 6 millions d'Américains et ce nombre devrait monter en flèche pour atteindre près de 13 millions d'ici 2050.
« Des études d'association antérieures à l'échelle du génome utilisant des variantes communes ont identifié des régions du génome, et parfois des gènes, associées à la maladie d'Alzheimer », explique le Dr Anita DeStefano, co-auteur principal de l'étude, professeur de biostatistique à BUSPH. « Les données sur la séquence complète du génome interrogent chaque paire de bases du génome humain et peuvent fournir davantage d'informations sur les changements génétiques spécifiques dans une région qui peuvent contribuer au risque ou à la protection contre la maladie d'Alzheimer. »
La valeur de la diversité dans la recherche génétique
Pour l'étude, les chercheurs ont effectué des analyses d'association de variantes uniques et des tests d'association d'agrégation de variantes rares en utilisant les données de séquençage du génome entier du projet de séquençage de la maladie d'Alzheimer (ADSP), une initiative de génétique que le Instituts nationaux de la santé développé en 2012 dans le cadre de l'objectif du National Alzheimer's Project Act de traiter et de prévenir la maladie. Les données ADSP incluent plus de 95 millions de variantes parmi 4 567 participants avec ou sans la maladie.
Parmi les 17 variantes significatives liées à la maladie d'Alzheimer, la KAT8 La variante était l’une des plus notables, car elle était associée à la maladie dans les analyses de variantes uniques et rares. Les chercheurs ont également trouvé des associations avec plusieurs rares TREM2 variantes.
« En utilisant le séquençage du génome entier dans un échantillon diversifié, nous avons pu non seulement identifier de nouvelles variantes génétiques associées au risque de maladie d'Alzheimer dans des régions génétiques connues, mais également déterminer si les associations connues et nouvelles sont partagées entre les populations », explique le co-auteur de l'étude. Dr Chloé Sarnowski, auteure principale et correspondante, professeure adjointe au département d'épidémiologie de l'école de santé publique UTHealth Houston.
L'ADSP comprend des participants ethniquement divers et des évaluations spécifiques à la population axées sur les sous-groupes blancs/d'ascendance européenne, noirs/afro-américains et hispaniques/latinos, ainsi qu'une méta-analyse multi-population. Historiquement, les populations noires et latino-américaines ont été sous-représentées dans les études génétiques sur la maladie d'Alzheimer, malgré une prévalence de la maladie plus élevée que les autres groupes ethniques.
« Il est important d'inclure des participants représentant une ascendance génétique diversifiée et des environnements divers en termes de déterminants sociaux de la santé pour comprendre l'ensemble du risque de maladie d'Alzheimer, car la prévalence de la maladie et la fréquence des variantes génétiques peuvent différer selon les populations », explique Dr DeStefano. La taille des échantillons dans les analyses spécifiques à la population était petite, de sorte que l’équipe avait une capacité limitée à détecter des associations, dit-elle, « mais nous avons reproduit les différences connues dans la population pour l’ensemble de la population. APOE gène, qui est l’un des gènes à risque les plus connus et les plus puissants pour la maladie d’Alzheimer.
Orientations futures de la recherche génétique sur la maladie d'Alzheimer
Dans les études futures, les chercheurs espèrent examiner les variantes spécifiques à la population qu’ils ont identifiées dans des échantillons beaucoup plus grands, ainsi qu’explorer comment ces variantes affectent le fonctionnement biologique.
« Nous travaillons actuellement à élargir cette recherche pour pouvoir utiliser le séquençage du génome entier avec des échantillons de plus grande taille dans l'ADSP afin de pouvoir examiner l'ensemble des variantes génétiques, non seulement dans les régions génétiques connues de la maladie d'Alzheimer, mais dans l'ensemble de la maladie d'Alzheimer. génome », déclare le Dr Gina Peloso, co-auteur principal, professeur agrégé de biostatistique à BUSPH.
L’étude a également été co-dirigée par Yanbing Wang alors qu’elle était doctorante en biostatistique à BUSPH. Il a été financé par l’Institut national sur le vieillissement sous les numéros de récompense U01 AG058589 et U01 AG068221.
