Une étude analysant plus de 4 000 métastases cancéreuses a révélé une présence bactérienne significative, affectant les réponses au traitement et soulignant le potentiel des thérapies anticancéreuses ciblées sur les bactéries. Crédit : Issues.fr.com
Des chercheurs de l'Institut néerlandais du cancer ont dressé un catalogue détaillé des bactéries vivant dans les métastases du cancer. Après avoir analysé plus de 4 000 tumeurs, ils ont mis en lumière la diversité de ces cohabitants et la manière dont ils pourraient interagir avec les cellules cancéreuses et leur environnement. Par exemple, certaines bactéries étaient associées à une pire réponse à l’immunothérapie. Cette étude ouvre la voie moyen de mieux comprendre comment les bactéries aident ou entravent le cancer (thérapie) et comment nous pouvons les utiliser au profit des patients. Les chercheurs publient leurs conclusions aujourd'hui dans la revue scientifique Cellule.
Sur et dans notre corps vivent des milliards de micro-organismes : bactéries, virus et levures – notre microbiome. Nous avons besoin d'eux et ils ont besoin de nous. Les bactéries nous aident par exemple à digérer nos aliments et coopèrent avec notre système immunitaire dans la lutte contre les agents pathogènes. Les bactéries intestinales en particulier ont été largement étudiées, notamment dans le contexte du cancer. Par exemple, ils peuvent influencer l’efficacité de l’immunothérapie et de la chimiothérapie.
Bactéries dans les métastases
Mais ces minuscules cohabitants logent également en dehors de l’intestin. Les bactéries se trouvent par exemple dans les tumeurs. Grâce à de nouvelles techniques, les chercheurs parviennent mieux à découvrir de quels microbes il s’agit. Mais la manière dont les bactéries atteignent une tumeur et ce qu’elles y font exactement reste largement inconnue, ce qui rend difficile de savoir à quel point elles sont importantes pour la maladie et l’effet des traitements.
26 types de cancer
Parce que de nombreux patients finissent par mourir de métastases et que de nombreux traitements les ciblent, les groupes de recherche d'Emile Voest et de Lodewyk Wessels ont examiné ces métastases de plus près. Après tout, on savait peu de choses sur les bactéries présentes dans ces tumeurs. En collaboration avec leurs collègues, entre autres, de l'Institut néerlandais du cancer et de l'Institut Oncode, ils ont désormais cartographié les bactéries présentes dans les métastases cancéreuses. Les deux groupes sont
Dans les tissus de plus de 4 000 métastases de 26 types de cancer, les chercheurs ont analysé le code du ADN présent. À partir de ce matériel génétique, vous pouvez voir non seulement quelles cellules humaines s’y trouvent, mais aussi quelles bactéries, car celles-ci possèdent également de l’ADN. À cette fin, ils ont utilisé des informations cliniques et des données ADN générées par la Hartwig Medical Foundation.
Analyse des données et résultats
Avec cette montagne d’informations inimaginable (400 téraoctets), ils ont utilisé la puissance informatique pour déterminer quelles bactéries se rassemblent à quels endroits (voir figure). Cela a nécessité beaucoup de programmation intelligente, car il y a relativement peu d’ADN bactérien dans un tel morceau de tissu.
« Étonnamment, ce ne sont pas seulement les métastases du cancer du côlon qui contiennent beaucoup de bactéries », explique le chercheur Thomas Battaglia. On pourrait s’y attendre, car la plupart de nos bactéries résident dans le côlon, d’où elles pourraient éventuellement se déplacer pendant les métastases vers d’autres parties du corps. « De plus, les bactéries présentes dans une métastase sont fortement liées à l'emplacement dans le corps, aux conditions qui y règnent et au type de cancer. »
Bactéries et efficacité du traitement
Ils ont également découvert un lien entre les bactéries et l’efficacité du traitement. Les patients atteints d'un cancer du poumon et Fusobactérie dans leurs métastases, par exemple, ont moins bien répondu à l’immunothérapie que leurs pairs sans cette bactérie. Thomas : « Nous avons également constaté que plus la communauté bactérienne est diversifiée, plus les cellules tumorales adjacentes sont actives. »
« Nos travaux ouvrent la porte à l'exploration de nouvelles formes de traitements, par exemple contre les bactéries qui pourraient aider la tumeur », explique la co-auteure Iris Mimpen. « Cela nous aide à comprendre comment fonctionne l'environnement complexe des tumeurs, un environnement dans lequel toutes sortes de cellules, y compris les bactéries, vivent ensemble et s'influencent mutuellement. »
Cette recherche a été financée par la Fondation AVL, la KWF Dutch Cancer Society et l'Institut Oncode.
