Dans une étude génétique majeure, plus de 5 000 variantes liées à un risque accru de cancer ont été identifiées dans le gène BAP1, révélant le potentiel de nouvelles thérapies ciblées et améliorant les tests génétiques pour diverses populations.
Des chercheurs ont identifié des variantes spécifiques d’un gène qui augmentent considérablement la probabilité de développer divers types de cancer. Cette découverte pourrait améliorer la détection précoce et faciliter la mise en place de traitements personnalisés pour diverses populations.
Les scientifiques ont identifié plus de 5 000 variantes génétiques qui favorisent le développement de certains cancers, ainsi qu’une cible thérapeutique potentielle qui pourrait traiter ou éventuellement empêcher le développement de ces cancers.
Des chercheurs du Wellcome Sanger Institute et leurs collaborateurs de l'Institut de recherche sur le cancer de Londres et de l'Université de Cambridge ont évalué l'impact sur la santé de tous les changements génétiques possibles dans le gène de « protection contre les tumeurs », BAP1Ils ont découvert qu’environ un cinquième de ces changements possibles étaient pathogènes, augmentant considérablement le risque de développer des cancers de l’œil, de la paroi pulmonaire, du cerveau, de la peau et du rein.
Les résultats, publiés dans Génétique de la naturesont disponibles gratuitement afin qu'ils puissent être immédiatement utilisés par les médecins pour aider à diagnostiquer les patients et choisir les thérapies les plus efficaces pour eux. Il est important de noter que, comme toutes les variantes possibles ont été évaluées, les résultats bénéficient aux individus d'origines ethniques diverses, qui ont historiquement été sous-représentés dans la recherche en génétique.
Potentiel de nouvelles thérapies contre le cancer
L'équipe a également découvert un lien entre certaines activités perturbatrices BAP1 Des variantes et des niveaux plus élevés d'IGF-1, une hormone et un facteur de croissance. Cette découverte ouvre la voie au développement de nouveaux médicaments qui pourraient inhiber ces effets nocifs, ralentissant ou empêchant potentiellement la progression de certains cancers.
La protéine BAP1 agit comme un puissant suppresseur de tumeur dans l'organisme, protégeant contre les cancers de l'œil, de la paroi pulmonaire, du cerveau, de la peau et du rein. Les variantes héréditaires qui perturbent la protéine peuvent augmenter jusqu'à 50 % le risque de développer ces cancers au cours de leur vie, généralement vers la cinquantaine.
La détection précoce de ces variantes par le biais d'un dépistage génétique peut guider les mesures préventives, améliorer considérablement l'efficacité du traitement et améliorer la qualité de vie des personnes concernées. Cependant, jusqu'à présent, on ne savait pas exactement quelles étaient les modifications génétiques spécifiques à ces maladies. BAP1 il faut être vigilant, en particulier en ce qui concerne les variantes rares qui provoquent un dysfonctionnement et favorisent la croissance du cancer.
Des chercheurs de l'Institut Sanger et leurs collaborateurs de l'Institut de recherche sur le cancer et de l'Université de Cambridge ont testé les 18 108 cas possibles ADN changements dans le BAP1 en modifiant artificiellement le code génétique de cellules humaines cultivées dans une boîte de Pétri, dans un processus connu sous le nom de « modification du génome par saturation ». Ils ont identifié que 5 665 de ces modifications étaient nocives et perturbaient les effets protecteurs de la protéine. L'analyse des données de la UK Biobank a confirmé que les individus porteurs de ces modifications nocives BAP1 les personnes atteintes de variantes ont plus de dix pour cent plus de chances d’être diagnostiquées avec un cancer que la population générale.
Lien entre les variantes du gène BAP1 et les niveaux d'IGF-1
L'équipe a également découvert que les personnes atteintes de maladies BAP1 Les variants ont des niveaux élevés d'IGF-1 dans leur sang, une hormone liée à la fois à la croissance du cancer et au développement du cerveau. Même les individus sans cancer ont montré ces niveaux élevés, ce qui suggère que l'IGF-1 pourrait être une cible pour de nouveaux traitements pour ralentir ou prévenir certains cancers. Des analyses plus poussées ont révélé des effets nocifs BAP1 des variantes et des niveaux d'IGF-1 plus élevés ont été associés à de moins bons résultats chez les patients atteints de mélanome uvéal, soulignant le potentiel des inhibiteurs de l'IGF-1 dans le traitement du cancer.
Notamment, la technique profile tous les profils possibles BAP1 des variantes provenant de populations diverses, et pas seulement celles qui prévalent dans les dossiers cliniques européens, contribuant ainsi à remédier à la sous-représentation des populations non européennes dans les études génétiques.
Le Dr Andrew Waters, premier auteur de l’étude au Wellcome Sanger Institute, a déclaré : « Les approches précédentes pour étudier la façon dont les variants affectent la fonction des gènes se sont déroulées à très petite échelle ou ont exclu des contextes importants qui peuvent contribuer à leur comportement. Notre approche fournit une image fidèle du comportement des gènes, ce qui permet des études plus vastes et plus complexes de la variation génétique. Cela ouvre de nouvelles possibilités pour comprendre comment ces changements entraînent des maladies. »
La professeure Clare Turnbull, responsable clinique de l'étude, professeure de génétique translationnelle du cancer à l'Institute of Cancer Research de Londres et consultante en génétique clinique du cancer à la Royal Marsden NHS Foundation, a déclaré : « Cette recherche pourrait permettre une interprétation plus précise des tests génétiques, des diagnostics plus précoces et de meilleurs résultats pour les patients et leurs familles. »
Le Dr David Adams, auteur principal de l’étude au Wellcome Sanger Institute, a déclaré : « Nous voulons nous assurer que les connaissances génétiques vitales soient accessibles et pertinentes pour tous, quelle que soit leur ascendance. Notre objectif est d’appliquer cette technique à un plus large éventail de gènes, en couvrant potentiellement l’ensemble du génome humain au cours de la prochaine décennie grâce à l’Atlas des effets des variantes. »
L'étude a été financée par le Wellcome Trust et Cancer Research UK.
