Blenny aux lèvres rouges, une espèce marine tropicale chez laquelle les chercheurs ont découvert les ichtyocolides. Crédit : Philippe Guillaume
Les scientifiques ont utilisé la reconstruction du génome pour identifier un parasite de poisson auparavant « invisible », présent dans le monde entier chez de nombreux poissons marins. espèces. Ce parasite, qui fait partie des apicomplexes, un groupe critique de parasites cliniques, avait été négligé dans les recherches antérieures. Sa présence est répandue à la fois géographiquement et parmi différentes espèces de poissons dans le monde, ce qui a des implications significatives pour la pêche commerciale et les chaînes alimentaires marines.
Une équipe internationale de scientifiques de l'École Rosenstiel des sciences marines, atmosphériques et terrestres de l'Université de Miami et de l'Institut de biologie évolutive (IBE), un centre collaboratif du Conseil national espagnol de la recherche (CSIC) et de l'Université Pompeu Fabra (UPF ), a identifié un nouveau parasite chez la blennie à lèvres rouges, un poisson tropical de récif. Cette recherche a également révélé la répartition mondiale de ce parasite dans les populations de poissons du monde entier.
Publié par Biologie actuellela recherche a utilisé une méthode innovante pour reconstruire une partie du génome du parasite à partir de données de séquençage obtenues auprès de son hôte, et être capable de détecter sa présence chez d'autres poissons à l'aide de « codes-barres » génétiques (ADN code-barres).
Un parasite « invisible » a été dévoilé
Malgré sa présence chez les poissons du monde entier, le parasite n'avait pas encore été correctement caractérisé. Les données génomiques de l’étude révèlent que ce parasite appartient à un groupe d’organismes jusqu’alors non caractérisés et ont été nommés ichtyocolides, du latin « habitant du poisson ».
« Même s’il avait déjà été identifié par microscopie, nous n’avions pas pu jusqu’à présent séparer le signal génomique du poisson hôte et du parasite. Pour la première fois, nous avons pu les identifier grâce à leur ADN et les placer dans le groupe bien connu des parasites apicomplexes », a déclaré Javier del Campo, responsable de l'étude et chercheur principal à l'IBE dans le domaine de l'écologie et de l'évolution microbiennes. groupe et à la Rosenstiel School de Miami.
Le parasite est présent dans les poissons du monde entier
Au-delà de permettre la description d’un tout nouveau groupe d’apicomplexes, la reconstruction du génome a permis aux chercheurs d’identifier une série de gènes pouvant être utilisés pour détecter la présence de cet organisme dans d’autres échantillons génomiques ou microbiologiques comme s’il s’agissait d’un « code-barres ».
« Une fois que nous avons trouvé des ichtyocolides chez la blennie à lèvres rouges, un poisson tropical, nous nous sommes demandés si elle ferait également partie du microbiote d'autres poissons », explique Anthony Bonacolta, doctorant en biologie et écologie marines à l'école Rosenstiel et premier chercheur en biologie marine. auteur de l'étude.
L’équipe a comparé l’ADN de ces apicomplexes avec les bases de données publiques des microbiomes de centaines d’espèces de poissons d’eau douce et d’eau de mer. Les résultats ont montré que ces parasites semblent associés à la majorité des espèces de poissons marins analysées et sont présents dans tous les océans. Il s’agirait donc de l’un des parasites les plus répandus parmi les poissons marins, avec des implications potentielles pour la pêche commerciale et les réseaux trophiques océaniques.
« De futures études pourraient nous aider à mieux comprendre l’impact de parasites aussi répandus que les ichtyocolides dans les écosystèmes marins », explique del Campo.
Un nouveau membre des parasites apicomplexes
Les ichtyocolides appartiennent aux Apicomplexa, un grand groupe de parasites qui incluent ceux qui causent le paludisme et la toxoplasmose. Cependant, ces parasites ne présentent pas de risque direct pour la santé humaine, mais il est important de les étudier pour la santé des écosystèmes océaniques et pour mieux comprendre l'évolution de ces parasites humains.
La découverte des ichtyocolides ajoute plus de contexte à cette évolution. Pour la première fois, ils sont placés comme un groupe frère d’habitants coralliens bien connus, les corallicolidés, également récemment décrits comme apicomplexes.
« L’étude des ichtyocolides révèle non seulement davantage sur l’évolution des principaux parasites, mais également sur d’autres traits fondamentaux des apicomplexes qui peuvent être importants d’un point de vue clinique. Ils peuvent utiliser des mécanismes d’infection similaires (car ils sont également un parasite sanguin) ou avoir une autre biologie similaire qui peut éclairer notre compréhension d’autres apicomplexes », a déclaré Bonacolta.
