Le peptide NQK-Q8 (couleur claire), un morceau de protéine de pointe du SRAS-CoV-2 que le virus utilise pour pénétrer dans les cellules, lié au sillon HLA-B*15:01 (orange). L’illustration est basée sur la structure cristalline du HLA-B*15:01 en complexe avec le peptide dérivé de pointe NQKLIANQF du virus SARS-CoV-2 (PDB Entry – 8ELH) publié par Augusto et al., 2023 (Nature). Crédit : André Luiz Lourenço
Une nouvelle étude montre que la variation génétique commune parmi les individus est responsable de la médiation SRAS-CoV-2 infection asymptomatique.
Vous êtes-vous déjà demandé pourquoi certaines personnes ne sont jamais tombées malades à cause COVID 19? Une étude publiée récemment dans la revue Nature montre que la variation génétique courante parmi les personnes est responsable de la médiation de l’infection asymptomatique du SRAS-CoV-2. Les résultats indiquent que les individus porteurs de cette variante ne se sentent jamais malades une fois infectés. Cette découverte passionnante est le résultat d’un travail collaboratif américano-australien dirigé par Danillo Augusto, Ph.D., professeur adjoint à l’Université de Caroline du Nord à Charlotte ; Jill Hollenbach, Ph.D., professeur à l’Université de Californie à San Francisco ; et Stephanie Gras, professeur à l’Université de La Trobe en Australie.
Le rôle des antigènes leucocytaires humains (HLA)
L’étude se concentre sur un groupe de gènes appelés antigènes leucocytaires humains (HLA). Ces gènes HLA codent pour des protéines utilisées par le système immunitaire pour identifier vos cellules saines et les distinguer de celles infectées par des bactéries et des virus. Le système HLA est essentiel à la réponse immunitaire et est également très variable selon les individus. En raison du rôle des HLA dans la lutte contre l’infection, les chercheurs se sont demandés s’il existait des variantes spécifiques qui nous rendraient plus protégés ou plus sensibles au SRAS-CoV-2. virus.
Danillo Augusto, professeur adjoint de sciences biologiques à l’UNC Charlotte. Crédit : UNC Charlotte
Résultats de la recherche et méthodologie
Hollenbach a dirigé la collecte de données qui a commencé au début de la pandémie. Premièrement, 29 947 personnes non vaccinées ont été dépistées à l’aide d’une application mobile conçue spécifiquement pour suivre les symptômes du COVID-19, et 1 428 ont signalé un test positif pour le virus. Tous les individus avaient leur ADN préalablement séquencés pour analyser leurs gènes HLA. Les chercheurs ont découvert que les individus porteurs du variant génétique HLA-B*15:01 étaient beaucoup plus susceptibles de rester asymptomatiques après l’infection. Il est impressionnant de constater que cette variante est présente chez environ 10 % de la population. En résumé, les individus qui avaient HLA-B*1501 dans leur génome n’ont pas pu échapper à l’infection, mais ils ont échappé à la maladie.
Aperçus sur la réponse immunitaire
« Nous avons émis l’hypothèse que leur système immunitaire pourrait réagir si rapidement et si puissamment que le virus serait éliminé avant de provoquer des symptômes. C’est comme avoir une armée qui sait déjà quoi chercher et qui peut reconnaître, grâce à son uniforme, que ce sont les méchants », selon Hollenbach.
Les molécules HLA présentent des morceaux du virus aux cellules effectrices immunitaires pour inspection. L’étude a utilisé des cellules provenant d’individus atteints de HLA-B*15:01 qui ont donné du sang plusieurs années avant la pandémie. Les résultats ont montré que ces individus possédaient des cellules T mémoire contre une particule spécifique du SRAS-CoV-2. Les personnes qui n’ont jamais eu de contact avec le SRAS-CoV-2 avaient déjà été exposées à d’autres virus et avaient développé une mémoire immunologique contre une particule du SRAS-CoV-2.
Leur mémoire immunologique susciterait une réponse beaucoup plus rapide et expliquerait pourquoi ces individus restaient asymptomatiques. Il reste néanmoins intriguant de savoir comment ils pourraient développer une mémoire immunologique contre le SRAS-CoV-2 sans jamais être exposés à ce virus.
Réponses immunologiques à réaction croisée
« Il est bien connu que d’autres types de coronavirus provoquent des rhumes saisonniers depuis des décennies. Nous avons émis l’hypothèse que ces individus avaient été exposés à des coronavirus saisonniers dans le passé et que, d’une manière ou d’une autre, les individus porteurs spécifiquement du HLA-B*15:01 pourraient rapidement tuer les cellules infectées par le SRAS-CoV-2 en raison de réponses immunologiques croisées. Ainsi, même si les méchants changeaient d’uniforme, l’armée serait toujours en mesure de les identifier grâce à leurs bottes ou peut-être à un tatouage sur leurs bras. C’est ainsi que fonctionne notre mémoire immunologique pour nous maintenir en bonne santé », a déclaré Augusto.
Après avoir soigneusement analysé les séquences génomiques de tous les coronavirus, l’étude a montré que cette particule du SARS-CoV-2 reconnue par HLA-B*15:01 chez les individus non exposés est très similaire aux particules virales d’autres coronavirus précédents. La recherche a démontré que les lymphocytes T d’individus pré-pandémiques pouvaient identifier les particules virales des anciens coronavirus et du SRAS-CoV-2 avec la même efficacité en montrant les structures cristallines et les tests d’affinité. Cela signifie que ces individus ont créé une mémoire immunologique pour les coronavirus précédents, mais en raison de la grande similitude de cette particule virale, leurs cellules T mémoire peuvent également reconnaître et tuer le SRAS-CoV-2 très rapidement.
Implications et recherches futures
Les résultats montrent un mécanisme permettant aux individus d’éviter d’être malades du SRAS-CoV-2 et le groupe de recherche prévoit de continuer à en apprendre davantage sur la réponse contre ce virus, ce qui se traduira par une meilleure compréhension des traitements et des vaccins contre le COVID-19.
Pour en savoir plus sur cette recherche, voir Démasquer le secret des « Super Dodgers » du COVID-19.
