Les scientifiques ont découvert en Éthiopie de nouvelles souches de paludisme qui sont à la fois résistantes aux médicaments et indétectables par les tests standards, ce qui pose un défi majeur aux efforts d’élimination du paludisme en Afrique.
Une équipe de scientifiques dirigée par l’Université Brown a mené une surveillance génomique, révélant des mutations chez les parasites responsables du paludisme, susceptibles de remettre en cause l’éradication du paludisme en Afrique.
Les scientifiques ont découvert en Éthiopie de nouvelles variantes de parasites du paludisme qui sont résistantes aux traitements existants et indétectables par les tests de diagnostic standards. Cette situation pourrait entraîner une augmentation des cas de paludisme et des décès, compliquant ainsi les efforts visant à éradiquer la maladie.
Les auteurs ont détaillé les résultats d’une étude de surveillance génomique menée dans Microbiologie naturelle. Déjà, des scientifiques avaient découvert en Ouganda, en Tanzanie et au Rwanda des souches du parasite responsable du paludisme qui étaient résistantes à la plupart des médicaments antipaludiques disponibles ; et séparément, des parasites du paludisme résistants aux tests de diagnostic sont apparus dans la Corne de l’Afrique.
Ces parasites se sont propagés indépendamment les uns des autres, mais la nouvelle étude est le premier rapport publié à confirmer la prévalence de ce type de souche de paludisme doublement résistante, a déclaré l’auteur de l’étude Jeffrey Bailey, professeur agrégé de recherche translationnelle, de pathologie et de médecine de laboratoire. à l’Université Brown.
« Maintenant, nous assistons essentiellement au pire des cas : les parasites porteurs de la mutation qui les rendent résistants au traitement ont également détecté des délétions chromosomiques qui les rendent invisibles aux tests de diagnostic », a déclaré Bailey. « Cela signifie qu’il sera plus difficile de détecter les personnes infectées, et que lorsque les personnes infectées seront traitées avec des médicaments antipaludiques, cela pourrait ne pas suffire à les empêcher de propager la maladie. »
Défis diagnostiques et résistance au traitement
La méthode standard pour diagnostiquer le paludisme en Afrique consiste à effectuer des tests de diagnostic rapide qui détectent dans le sang des protéines parasitaires spécifiques qui sont fortement exprimées. Les tests peuvent confirmer le paludisme même si le patient est asymptomatique. Les parasites dépourvus des gènes de ces protéines ont évolué pour être invisibles aux tests.
Le traitement de première intention contre le paludisme recommandé par l’Organisation mondiale de la santé est une thérapie combinée impliquant des composés médicamenteux à base d’artémisinine, qui tendent à être très efficaces pour prévenir les décès et réduire la transmission. Les mutations désormais détectées en Afrique confèrent une résistance à l’artémisinine.
L’équipe de recherche de Bailey à Brown, en étroite collaboration avec les chercheurs de l’Institut éthiopien de santé publique et de l’Université de Caroline du Nord à Chapel Hill, a mené une analyse génomique comparative d’échantillons de parasites du paludisme avec les gènes exprimant des protéines supprimés qui avaient été collectés à travers trois régions d’Ethiopie. Dirigé par Bailey, co-directeur du doctorat. Dans le cadre du programme Brown’s Center for Computational Molecular Biology, les scientifiques ont utilisé le séquençage moléculaire pour évaluer la prévalence des mutations qui confèrent une résistance à l’artémisinine. Abebe Fola, chercheur postdoctoral au laboratoire de Bailey, a joué un rôle déterminant dans ce travail et est le premier auteur de l’article.
Résultats et prévalence du paludisme en Éthiopie
Ils ont découvert que 8,2 % des parasites résistants aux médicaments portaient également des délétions du gène exprimant la protéine qui les rendaient détectables par les tests de diagnostic.
En Éthiopie, l’incidence globale du paludisme est faible, mais la maladie reste endémique dans 75 % du pays, avec 65 % de la population à risque. Plus de 5 millions d’épisodes de paludisme surviennent chaque année. Le gouvernement éthiopien s’est fixé comme objectif l’élimination du paludisme d’ici 2030, et un diagnostic et un traitement rapides avec des médicaments efficaces constituent la pierre angulaire du programme d’élimination du paludisme.
« La propagation de ces parasites rendra certainement plus difficile l’élimination du paludisme en Éthiopie et ailleurs en Afrique et entraînera probablement une augmentation des cas et des décès », a déclaré Bailey.
Les scientifiques ont conclu qu’une surveillance étroite de la propagation des parasites résistants aux médicaments et aux diagnostics est nécessaire, notant qu’une meilleure compréhension de la manière dont ces mutations émergent, interagissent et se propagent est essentielle au succès des futurs efforts de contrôle et d’élimination du paludisme en Afrique.
En outre, a déclaré Bailey, il existe un besoin urgent de développer de nouveaux traitements, en plus de l’artémisinine, pour traiter le paludisme, ainsi que des vaccins pour prévenir et ralentir la propagation de la maladie.
La capacité de mener une surveillance génomique pour surveiller les mutations tout en recherchant de nouvelles a considérablement progressé au cours de la dernière décennie, a déclaré Bailey, avec l’émergence et le perfectionnement du séquençage de nouvelle génération. Son laboratoire à Brown a mis au point des techniques à haut débit pour séquencer plusieurs gènes à la fois et a collaboré à des projets comme l’étude actuelle avec des équipes de recherche d’autres universités ainsi qu’avec des agences de santé dans des pays comme l’Ouganda. Alors que l’analyse de cette étude a été menée à Brown, Bailey et d’autres membres de l’équipe de recherche travaillent au renforcement des capacités de surveillance génomique en Éthiopie et dans d’autres régions d’Afrique.
Le projet a été financé en partie par les États-Unis Instituts nationaux de la santé (R01AI132547, K24AI134990, R01AI1777791) ; le Ministère de la Santé-Éthiopie (EPHI5405) ; et la Fondation Bill et Melinda Gates par l’intermédiaire de l’Organisation mondiale de la santé (OPP1209843).
