Une étude récente s’étalant sur 20 ans au Royaume-Uni et en Norvège relie l’utilisation d’antibiotiques à la propagation d’E. coli résistante aux antibiotiques, montrant que l’impact varie selon le type d’antibiotique et la génétique bactérienne. Les résultats soulignent la complexité de la résistance aux antibiotiques, soulignant la nécessité de poursuivre les recherches pour bien comprendre et combattre la propagation des superbactéries.
Les chercheurs ont étudié l’escalade de la résistance aux antibiotiques au Royaume-Uni et en Norvège au cours des deux dernières décennies, soulignant que l’augmentation de la résistance n’est pas uniquement attribuée à l’utilisation d’antibiotiques.
Pour la première fois, une étude a examiné l’influence de la consommation d’antibiotiques sur la croissance de bactéries résistantes aux médicaments au Royaume-Uni et en Norvège au cours des deux dernières décennies. Les résultats indiquent que même si l’utilisation croissante d’antibiotiques a contribué à la prolifération des superbactéries, d’autres facteurs entrent également en jeu.
Des chercheurs du Wellcome Sanger Institute, du Université d’Oslo, l’Université de Cambridge et ses collaborateurs ont mené une comparaison génétique à haute résolution des bactéries. Ils ont comparé plus de 700 nouveaux échantillons de sang avec près de 5 000 échantillons bactériens précédemment séquencés pour répondre aux questions sur les facteurs qui influencent la propagation des bactéries résistantes aux antibiotiques. Escherichia coli (E. coli).
L’étude, récemment publiée dans le Microbe à lancette, montre qu’une utilisation accrue d’antibiotiques entraîne dans certains cas une augmentation du nombre de bactéries résistantes au traitement. Cependant, les chercheurs ont confirmé que cela varie en fonction du type d’antibiotique à large spectre utilisé. Ils ont également découvert que le succès des gènes de résistance aux antibiotiques dépend de la constitution génétique des bactéries qui les portent.
Comprendre la résistance aux antibiotiques
Reconnaître tous les principaux facteurs à l’origine de la résistance aux antibiotiques peut aider à mieux comprendre comment ces bactéries se propagent et ce qui les empêche. Cela pourrait alors mieux éclairer les interventions de santé publique qui utilisent une vision complète de l’environnement pour aider à stopper la propagation des infections résistantes aux traitements.
La bactérie, E. coli est une cause fréquente d’infections sanguines dans le monde. Le type de E. coli responsable de ces infections se trouve généralement dans l’intestin, où il ne cause aucun dommage. Cependant, s’il pénètre dans la circulation sanguine en raison d’un système immunitaire affaibli, il peut provoquer des infections graves, voire mortelles.
Constituant un défi supplémentaire pour les prestataires de soins de santé, la résistance aux antibiotiques, en particulier la résistance multidrogue (MDR), est devenue une caractéristique fréquente de ces infections. Au Royaume-Uni, plus de 40 pour cent des E. coli Les infections du sang sont résistantes à un antibiotique clé utilisé dans le traitement des infections graves dans les hôpitaux.
Utilisation des antibiotiques et variabilité de la résistance
Taux de résistance aux antibiotiques dans E. coli varient à l’échelle mondiale. Par exemple, le taux de résistance à un antibiotique différent, couramment utilisé pour traiter les infections des voies urinaires causées par E. colivariait entre 8,4 pour cent et 92,9 pour cent selon les pays.
La résistance aux antibiotiques est un sujet de recherche depuis des décennies, et les données de surveillance issues d’études antérieures ont constamment montré une association entre l’utilisation d’antibiotiques et une fréquence accrue de MDR chez les bactéries dans le monde entier, y compris au Royaume-Uni.
Des études antérieures ont suggéré une coexistence stable de bactéries résistantes et non résistantes. E. coli souches et dans certains cas, les bactéries non résistantes réussissent mieux. Cependant, auparavant, il n’était pas possible d’évaluer le rôle des facteurs génétiques en raison du manque d’ensembles de données longitudinales impartiales à grande échelle.
Cette nouvelle étude, menée par le Wellcome Sanger Institute, l’Université d’Oslo et ses collaborateurs, est la première fois qu’il est possible de comparer directement le succès des différentes souches de E. coli entre deux pays – la Norvège et le Royaume-Uni – et expliquent les différences en fonction des niveaux d’utilisation d’antibiotiques à l’échelle nationale.
Résistance aux antibiotiques spécifique à un pays
En analysant des données couvrant près de 20 ans, ils ont découvert que l’utilisation d’antibiotiques était liée à une résistance accrue dans certains cas, en fonction du type d’antibiotique. Une classe d’antibiotiques, les bêta-lactamines sans pénicilline, était utilisée en moyenne trois à cinq fois plus par personne au Royaume-Uni qu’en Norvège. Cela a conduit à une incidence plus élevée d’infections par certains médicaments multirésistants. E. coli souche.
Cependant, le Royaume-Uni utilise également plus souvent l’antibiotique triméthoprime, mais l’analyse n’a pas révélé de niveaux de résistance plus élevés au Royaume-Uni lorsque l’on compare les médicaments courants. E. coli souches trouvées dans les deux pays.
L’étude a révélé que la survie des bactéries MDR dépendait des souches de E. coli se trouvaient dans le milieu environnant. En raison de cela et d’autres pressions sélectives dans une région, les chercheurs ont conclu qu’il n’est pas possible de supposer que l’utilisation généralisée d’un type d’antibiotique aura le même effet sur les bactéries résistantes aux antibiotiques répandues dans différents pays.
L’importance de la recherche continue
Les scientifiques soulignent que leurs résultats justifient des efforts de recherche soutenus pour identifier les autres facteurs responsables de la propagation du virus. E. coli et d’autres bactéries cliniquement importantes dans une gamme de contextes écologiques. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour comprendre pleinement l’effet combiné des antibiotiques, des voyages, des systèmes de production alimentaire et d’autres facteurs qui déterminent les niveaux de résistance aux médicaments dans un pays.
Mieux comprendre les souches qui peuvent supplanter les souches résistantes aux antibiotiques E. coli peut conduire à de nouvelles façons d’aider à arrêter la propagation. Par exemple, les tentatives visant à augmenter la quantité de bactéries non résistantes et non nocives dans une zone.
Le Dr Anna Pöntinen, co-premier auteur de l’Université d’Oslo, en Norvège, et scientifique invitée au Wellcome Sanger Institute, a déclaré : « Notre étude à grande échelle nous a permis de commencer à répondre à certaines des questions de longue date sur les causes causales. bactéries multirésistantes dans une population. Cette recherche n’a été possible que grâce à la surveillance systématique nationale des agents pathogènes bactériens pratiquée au Royaume-Uni et en Norvège. Sans de tels systèmes, les scientifiques seraient considérablement plus limités quant à ce qu’ils peuvent apprendre grâce au pouvoir de la génomique. »
Le professeur Julian Parkhill, co-auteur de l’Université de Cambridge, a déclaré : « Notre étude suggère que les antibiotiques sont des facteurs modulateurs dans le succès des maladies résistantes aux antibiotiques. E. coli, au lieu de la seule cause. Nos recherches ont retracé l’impact de plusieurs antibiotiques à large spectre et montrent que leur influence varie selon les pays et les régions. Dans l’ensemble, notre analyse génétique complète montre qu’il n’est pas toujours possible de prédire l’impact de l’utilisation d’antibiotiques sur une zone sans connaître la constitution génétique des souches bactériennes présentes dans cet environnement.
Le professeur Jukka Corander, auteur principal du Wellcome Sanger Institute et de l’Université d’Oslo, en Norvège, a déclaré : « Résistant aux traitements E. coli est un problème majeur de santé publique mondiale. Bien qu’il soit admis depuis longtemps que la surutilisation des antibiotiques joue un rôle dans l’augmentation et la propagation des superbactéries, notre étude souligne que le niveau de résistance aux médicaments dans les populations les plus répandues E. coli les souches peuvent varier considérablement. L’utilisation d’antibiotiques constituera une pression sélective, et notre étude montre que ce n’est pas le seul facteur qui influe sur le succès de ces bactéries. Continuer à utiliser la génomique pour acquérir une compréhension détaillée des facteurs sous-jacents du succès bactérien est crucial si nous voulons contrôler la propagation des superbactéries.
Cette recherche a été financée par la Fondation Trond Mohn, Marie Skłodowska – Curie Actions, le Conseil européen de la recherche, la Royal Society et Wellcome. Une liste complète de remerciements peut être trouvée sur la publication.
