Une comparaison du génome de la thylacine à d'autres marsupiaux a révélé que les créatures perdaient la diversité génétique bien avant l'arrivée des humains et des dingos en Australie
Des thylacines ont été trouvées une fois dans toute l'Australie et la Nouvelle-Guinée
La perte de gènes cruciaux sur des millions d'années avant l'arrivée des humains en Australie peut avoir laissé des thylacines plus vulnérables à l'extinction.
La thylacine ou le tigre Tasmanien (Thylacinus cynocephalus) a été le dernier survivant d'une famille de marsupiaux connus sous le nom de Thylacinidae qui vivait autrefois dans toute l'Australie et la Nouvelle-Guinée.
Il a été éteint sur le continent australien il y a 2000 ans, avec la chasse par les humains et la concurrence de Dingoes considérés comme des raisons majeures de leur déclin. Après l'arrivée des Européens en Tasmanie, les animaux ont été persécutés par les agriculteurs et une prime gouvernementale, et le dernier spécimen est décédé au zoo de Hobart en 1936.
Nagarjun Vijay et Buddhabhushan Girish Salve à l'Institut indien de l'enseignement et de la recherche en sciences, Bhopal s'est d'abord intéressé au génome du tigre Tasmanien tout en étudiant le génome du tigre du Bengale (Panthera Tigre Tigre).
«Nous voyions des parallèles entre l'extinction de la thylacine avec notre propre tigre», explique Vijay. «Et il y a beaucoup d'élan pour conserver le tigre en Inde.»
La paire soupçonnait que les hypercarnivores comme le tigre du Bengale et le tigre Tasmanien ont, à travers leur histoire évolutive, perdus qui peuvent les rendre vulnérables lorsqu'ils sont exposés à des changements environnementaux ou à de nouvelles maladies.
Ils ont analysé les enregistrements génétiques précédemment récupérés à partir de spécimens du musée Thylacine et les ont comparés au génome de leur proche parent, le diable Tasmanien (Sarcophilus Harrisii) et autres marsupiaux.
Contrairement à presque tous les autres marsupiaux, y compris les diables tasmaniens, les thylacines avaient perdu au moins quatre gènes importants, appelés SAMD9L, HSD17B13, CUZD1 et VWA7.
Vijay dit qu'ils ont été surpris de découvrir que la perte des gènes ne semblait pas se produire après que la population de Tasmanie s'est isolée lorsque le niveau de la mer a commencé à augmenter il y a environ 10 000 ans.
La perte de ces gènes pourrait avoir des avantages dans certaines conditions dans le passé, mais elle a potentiellement compromis la santé de l'espèce en réduisant les défenses antivirales, les processus métaboliques, la lactation et leur sensibilité au cancer et à la pancréatite, vijay et salve suggèrent.
Les thylacines perdantes SAMD9L, CUZD1 et VWA7 Il y a au moins 6 millions d'années à un moment de changement climatique massif – une période qui a vu l'espèce augmenter considérablement en taille et devenir hypercarnivore, subsistant presque entièrement sur la viande.
«Le récit global a toujours été que c'est surtout une intervention humaine, ou des changements anthropiques, qui ont eu un effet sur l'extinction des thylacines», explique Vijay. «Et nous pensions, peut-être que nous verrons des gènes perdus qui sont liés à la maladie et c'est ce que nous avons trouvé.»
Timothy Churchill à l'Université de Nouvelle-Galles du Sud, Sydney, dit qu'il ne fait aucun doute que les changements climatiques en Australie sur des millions d'années avant l'arrivée des humains ont entraîné une perte dramatique de la diversité génétique des thylacines. Il dit qu'il est également possible que les pertes de gènes rapportées dans la nouvelle étude auraient pu rendre les tigres de Tasmanie plus sensibles aux maladies, mais confirmer que cela nécessiterait beaucoup plus de recherches.
«C'est l'une de ces lignées qui se sont en quelque sorte en quelque sorte reculées dans un coin et ont réussi à faire sortir sa survie dans son créneau pendant longtemps», explique Churchill. « Mais une fois que Canids comme le Dingo est arrivé, c'était le clou dans le cercueil sur le continent. Ensuite,, évidemment, une fois que nous avons fait notre ennemi en Tasmanie, c'était la fin d'eux. »
