Découvrir quels microbes intestinaux une personne porte n’est peut-être pas aussi simple que le prétendent de nombreuses entreprises.
Sept sociétés de tests du microbiome s'adressant directement aux consommateurs ont chacune obtenu trois échantillons fécaux identiques, mais ont renvoyé des résultats différents sur les microbes intestinaux présents, rapportent des chercheurs le 26 février dans Biologie des communications.
Les résultats mettent en évidence les divergences entre les entreprises qui prétendent donner aux consommateurs un aperçu de leur santé intestinale. Cela est important parce que les consommateurs peuvent prendre des probiotiques dont ils n'ont pas besoin, modifier leur régime alimentaire de manière nocive ou même subir des greffes fécales sur la base de résultats de tests microbiologiques inexacts, affirment des chercheurs de l'Université du Maryland à Baltimore et du National Institute of Standards and Technology de Gaithersburg, Maryland (le généticien moléculaire Scott Jackson a depuis quitté le NIST et est maintenant consultant pour les entreprises dont les produits impliquent des microbes.)
L'équipe du NIST a créé une norme fécale en mettant les selles de plusieurs personnes dans un mélangeur pour créer un échantillon homogénéisé. « Nous savons que la biologie est identique dans tous ces échantillons », a déclaré la microbiologiste du NIST Stephanie Servetas le 25 février lors d'un point de presse. « Ce que ce matériel est censé faire, c'est vraiment dire dans quelle mesure les résultats sont reproductibles, que ce soit entre entreprises ou au sein d'une entreprise, mais il ne pourra pas nous dire qui était le plus proche de la bonne réponse. »
Certaines entreprises concordaient avec les microbes qu’elles ont identifiés dans les trois échantillons. Mais une entreprise a produit un résultat radicalement différent sur l’un des trois échantillons testés. Il a classé les deux résultats similaires comme « sains » et la valeur aberrante comme « malsaine ». D’autres ont identifié bon nombre des mêmes types de bactéries dans les échantillons répliqués, mais ont montré des quantités variables de ces bactéries. Les écarts entre les résultats des entreprises sur l'échantillon standard étaient similaires à la variabilité entre les échantillons provenant de différentes personnes.
Le NIST a commencé à vendre l'étalon fécal aux entreprises l'année dernière pour qu'il l'utilise à des fins d'étalonnage et de contrôle qualité, ce qui pourrait entraîner une amélioration des méthodes de test à l'avenir, a déclaré Servetas. L'objectif n'est pas d'obliger les entreprises à adopter les mêmes méthodes ou d'étouffer l'innovation, a-t-elle déclaré, mais « il devrait y avoir des lignes directrices minimales et des contrôles » qui rendraient les résultats plus cohérents.
Un échantillon, trois résultats
Une entreprise présentait de grandes incohérences dans les genres de microbes (indiqués par des couleurs différentes, le gris étant non spécifié) qu'elle a identifiées dans trois répétitions d'un échantillon standard. L’entreprise a classé les deux premiers résultats comme sains et le troisième comme malsain.
Servettes SL et autres./Biologie des communications 2026
Servettes SL et autres./Biologie des communications 2026
