Des chercheurs de l'Université de Houston, dirigés par Navin Varadarajan, ont découvert un nouveau sous-ensemble de lymphocytes T, appelé CD8-fit, qui sont associés à de meilleurs résultats dans les thérapies à base de lymphocytes T contre le cancer. En utilisant une combinaison de la méthode TIMING et du séquençage de l’ARN unicellulaire, l’équipe a identifié une signature moléculaire dans ces cellules T qui est en corrélation avec des résultats cliniques positifs à long terme. Les résultats, qui impliquent également des collaborations avec des institutions prestigieuses et des contributions de chercheurs diplômés et postdoctoraux notables, pourraient révolutionner les thérapies personnalisées à base de lymphocytes T pour divers cancers.
Des chercheurs de l’Université de Houston ont identifié des lymphocytes T CD8-fit dotés d’une motilité élevée et de capacités de destruction en série, améliorant potentiellement les thérapies anticancéreuses à base de lymphocytes T. L'étude a utilisé l'approche TIMING et ARN séquençage, révélant des signatures moléculaires qui prédisent des résultats positifs pour les patients.
Un groupe de chercheurs en cancérologie de l'Université de Houston a identifié un nouveau type de lymphocytes T, qui pourrait améliorer les résultats pour les patients subissant des thérapies par lymphocytes T.
L’immunothérapie basée sur les lymphocytes T recèle un immense potentiel dans la lutte contre le cancer, et souvent dans son éradication. Cette approche active et conçoit le système immunitaire d'un patient, en particulier ses cellules T, pour identifier, attaquer et détruire les cellules cancéreuses. En conséquence, les cellules T du corps fonctionnent comme des médicaments vivants.
Même si l’immunothérapie par lymphocytes T a révolutionné le traitement du cancer, il reste encore beaucoup à apprendre. Malheureusement, tous les patients ne répondent pas à ces thérapies. Une meilleure compréhension des propriétés des cellules T modifiées est donc nécessaire pour améliorer les réponses cliniques.
Une de ces études, financée par une subvention du Instituts nationaux de la santéest rapporté dans Cancer naturel par le laboratoire de Navin Varadarajan, professeur MD Anderson au département William A. Brookshire de génie chimique et biomoléculaire. L’étude utilise l’approche brevetée TIMING (Timelapse Imaging Microscopy in Nanowell Grids) qui applique l’IA visuelle pour évaluer le comportement, le mouvement et la capacité à tuer des cellules.
Navin Varadarajan, professeur MD Anderson de génie chimique et biomoléculaire à l'Université de Houston, a publié dans Nature Cancer la découverte de nouvelles cellules T tuant le cancer. Crédit : Université de Houston
Découverte des cellules T CD8-Fit
« Nos résultats ont montré qu'un sous-ensemble de cellules T, étiquetées comme cellules T CD8-fit, sont capables d'une motilité élevée et d'une destruction en série, trouvées uniquement chez les patients présentant une réponse clinique », rapporte le premier auteur et récent diplômé de l'UH, Ali Rezvan dans Cancer naturel. En plus de l'équipe UH, les collaborateurs incluent Sattva Neelapu et Harjeet Singh, du MD Anderson Cancer Center de l'Université du Texas, à Houston ; Mike Mattie, Kite Pharma ; Nabil Ahmed, Hôpital pour enfants du Texas, Baylor College of Medicine, Houston ; et Mohsen Fathi, CellChorus.
Pour découvrir les cellules CD8-fit, l’équipe a utilisé TIMING pour suivre les interactions entre les cellules T individuelles et les cellules tumorales sur des milliers de cellules et a intégré les résultats aux données de séquençage d’ARN unicellulaire.
« Les lymphocytes T des récepteurs d'antigènes chimériques (CAR) utilisés pour le traitement des tumeurs malignes des lymphocytes B peuvent identifier des sous-ensembles de lymphocytes T ayant une activité clinique supérieure. En utilisant des produits de perfusion de patients atteints d'un lymphome à grandes cellules B, nous avons intégré le profilage fonctionnel utilisant TIMING avec le profilage subcellulaire et le scRNA-seq pour identifier une signature de cellules T CD8 multifonctionnelles (CD8-fit) », a déclaré Rezvan. « Nous avons profilé ces cellules à l’aide du séquençage d’ARN unicellulaire pour identifier la signature moléculaire adaptée à CD8 qui pourrait être utilisée pour prédire les résultats durables des thérapies à base de lymphocytes T pour les patients et avons validé nos résultats avec des ensembles de données indépendants. »
L'équipe a également découvert que la signature CD8-fit est présente dans les cellules T préfabriquées, persiste longitudinalement chez les patients après la perfusion et, plus important encore, est associée à des réponses cliniques positives à long terme. Selon les chercheurs, il est probable que ces cellules T puissent apporter des bénéfices cliniques à d’autres tumeurs.
« Ce travail illustre l'excellence des étudiants diplômés Ali Rezvan et Melisa Montalvo ; et les chercheurs postdoctoraux Melisa Martinez-Paniagua et Irfan Bandey, entre autres », a déclaré Varadarajan.
CellChorus, une spin-off du Single Cell Lab de Varadarajan à l'UH, développe la plateforme TIMING alimentée par l'IA. La société a récemment annoncé une subvention de 2,5 millions de dollars pour la recherche sur l'innovation dans les petites entreprises du National Center for Advancing Translational Sciences des National Institutes of Health pour faire progresser TIMING pour les applications de thérapie cellulaire.
