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L’ADN dit tout : les véritables coupables de la chute des plus grosses bêtes de la Terre

SciTechDaily

Les hommes préhistoriques attaquent un éléphant. De nouvelles recherches montrent que ce sont les humains et non le climat qui ont provoqué un fort déclin de presque toute la mégafaune sur Terre il y a 50 000 ans. Crédit : Imprimé pour la première fois dans Bryant & Gay, 1883. Sculpture sur bois par E. Bayard.

Pendant des années, les scientifiques se sont demandé si les humains ou le climat avaient causé le déclin spectaculaire de la population de grands mammifères au cours des derniers milliers d’années. Une nouvelle étude de Université d’Aarhus confirme que le climat ne peut pas être l’explication.

Il y a environ 100 000 ans, les premiers humains modernes ont émigré en grand nombre hors d’Afrique. Ils étaient doués pour s’adapter à de nouveaux habitats et se sont installés dans pratiquement tous les types de paysages – des déserts aux jungles en passant par la taïga glacée de l’extrême nord.

Une partie du succès réside dans la capacité de l’homme à chasser de gros animaux. Grâce à des techniques de chasse intelligentes et à des armes spécialement conçues, ils perfectionnèrent l’art de tuer même les mammifères les plus dangereux.

Mais malheureusement, le grand succès de nos ancêtres s’est fait au détriment des autres grands mammifères.

Il est bien connu que de nombreux grands espèces a disparu à l’époque de la colonisation mondiale par les humains modernes. Aujourd’hui, de nouvelles recherches de l’Université d’Aarhus révèlent que les grands mammifères qui ont survécu ont également connu un déclin spectaculaire.

Gorille oriental

Le gorille de l’Est est l’un des mammifères qui a le plus décliné. Aujourd’hui, il ne vit que dans de petites zones en République démocratique du Congo. Crédit : Michalsloviak

En étudiant le ADN Sur 139 espèces vivantes de grands mammifères, les scientifiques ont pu montrer que l’abondance de presque toutes les espèces a chuté de façon spectaculaire il y a environ 50 000 ans.

C’est ce qu’affirme Jens-Christian Svenning, professeur et directeur du Centre pour la dynamique écologique dans une nouvelle biosphère (ECONOVO) de la Fondation nationale danoise de recherche à l’Université d’Aarhus, et initiateur de l’étude.

Grand rhinocéros à une corne

Un autre grand mammifère gravement décimé est le plus grand rhinocéros à cornes. Il vit en Inde et est l’une des cinq espèces de rhinocéros restantes. Crédit : Mayank1704

« Nous avons étudié l’évolution de grandes populations de mammifères au cours des 750 000 dernières années. Pendant les 700 000 premières années, les populations étaient assez stables, mais il y a 50 000 ans, la courbe s’est rompue et les populations ont chuté de façon spectaculaire sans jamais se rétablir », dit-il, et il poursuit :

« Au cours des 800 000 dernières années, le globe a fluctué entre des périodes glaciaires et des périodes interglaciaires environ tous les 100 000 ans. Si le climat en était la cause, nous devrions observer des fluctuations plus importantes lorsque le climat a changé il y a 50 000 ans. Mais nous ne le faisons pas. Les humains sont donc l’explication la plus probable.

Qui a tué les grands mammifères ?

Depuis des décennies, les scientifiques débattent des causes de l’extinction ou du déclin rapide des grands mammifères au cours des 50 000 dernières années.

D’un côté se trouvent les scientifiques qui estiment que les fluctuations rapides et sévères du climat en sont la principale explication. Par exemple, ils pensent que le mammouth laineux a disparu parce que la steppe froide des mammouths a en grande partie disparu.

De l’autre côté se trouve un groupe qui croit que la prédominance de l’homme moderne (Homo sapiens) en est l’explication. Ils croient que nos ancêtres chassaient les animaux à tel point qu’ils ont complètement disparu ou ont été gravement décimés.

Jusqu’à présent, les fossiles des 50 000 dernières années constituent l’une des preuves les plus importantes du débat. Ils montrent que l’extinction forte et sélective des grands animaux dans le temps et dans l’espace correspond à peu près à la propagation de l’homme moderne dans le monde. L’extinction des animaux ne peut donc guère être liée au climat. Néanmoins, le débat continue.

La nouvelle étude présente de toutes nouvelles données qui jettent un nouvel éclairage sur le débat. En examinant l’ADN de 139 grands mammifères vivants – des espèces qui ont survécu au cours des 50 000 dernières années sans disparaître – les chercheurs peuvent montrer que les populations de ces animaux ont également diminué au cours de cette période. Cette évolution semble être liée à la prolifération humaine et non au changement climatique.

Nilgiritahr

Nilgiritahr est étroitement apparenté à la chèvre, mais est en réalité une antilope. Il vit dans les montagnes du sud de l’Inde. Autrefois, la population de Nilgiritahr était beaucoup plus nombreuse. Crédit : Ameshshenai

L’ADN contient l’histoire à long terme de l’espèce

Au cours des 20 dernières années, le séquençage de l’ADN a connu une révolution. Cartographier des génomes entiers est devenu à la fois facile et peu coûteux, ce qui a permis de cartographier l’ADN de nombreuses espèces.

Les génomes cartographiés des espèces du monde entier sont librement accessibles sur Internet – et ce sont les données que le groupe de recherche de l’Université d’Aarhus a utilisées, explique le professeur assistant Juraj Bergman, chercheur principal à l’origine de la nouvelle étude.

« Nous avons collecté des données sur 139 grands mammifères vivants et analysé l’énorme quantité de données. Il existe environ 3 milliards de points de données pour chaque espèce, cela a donc pris beaucoup de temps et beaucoup de puissance de calcul », dit-il et poursuit :

« L’ADN contient de nombreuses informations sur le passé. La plupart des gens connaissent l’arbre de vie, qui montre où les différentes espèces se sont développées et quels ancêtres communs elles ont. Nous avons fait la même chose avec les mutations de l’ADN. En regroupant les mutations et en construisant un arbre généalogique, nous pouvons estimer la taille de la population d’une espèce spécifique au fil du temps.

Plus la population d’un animal est grande, plus les mutations se produiront. C’est vraiment une question de mathématiques simples. Prenez les éléphants, par exemple. Chaque fois qu’un éléphant est conçu, il est possible qu’un certain nombre de mutations se produisent et qu’il les transmette aux générations suivantes. Plus de naissances signifie plus de mutations.

Cerf du Père Davids

Le cerf de Peré Davids, montré sur cette photo, ne vit plus à l’état sauvage. Les seuls animaux qui subsistent aujourd’hui vivent dans les zoos et les parcs animaliers. Crédit : Tim Felce

Les grands mammifères

Les 139 grands mammifères examinés dans le cadre de l’étude sont tous des espèces qui existent aujourd’hui. Ils comprennent entre autres des éléphants, des ours, des kangourous et des antilopes.

On estime qu’il existe 6 399 espèces de mammifères sur Terre, mais les 139 mégafaunes existantes ont été sélectionnées dans cette étude pour tester l’évolution de leurs populations au cours des 40 000 à 50 000 dernières années, lorsque de grands animaux similaires ont disparu.

Les grands mammifères sont également appelés mégafaune et sont définis comme des animaux pesant plus de 44 kg à l’âge adulte. Les humains sont donc également considérés comme une mégafaune. Dans l’étude, cependant, les chercheurs ont examiné des espèces pesant à peine 22 kg, de sorte que tous les continents ont été représentés, à l’exception de l’Antarctique.

Source : Journal de Mammalogie

Sitatunga

Dans l’eau voici le Sitatunga. C’est une antilope qui vit dans plusieurs pays d’Afrique. Le sitatunga vit dans les zones marécageuses et était autrefois trouvé en plus grand nombre. Crédit : Kennyannydenny

Examiner les parties neutres de l’ADN

Cependant, la taille de la population d’éléphants n’est pas la seule chose qui affecte le nombre de mutations.

Si la zone dans laquelle vivent les éléphants s’assèche soudainement, les animaux sont mis sous pression – et cela affecte la composition des mutations. Il en va de même si deux groupes isolés d’éléphants se rencontrent soudainement et mélangent leurs gènes.

Si la taille de la population n’est pas la seule à affecter le nombre de mutations qui se produisent, on pourrait penser que les résultats sont plutôt incertains. Mais ce n’est pas le cas, explique Juraj Bergman.

« Seuls 10 % des génomes des mammifères sont constitués de gènes actifs. Une forte pression de sélection exercée par l’environnement ou la migration entraînera principalement des mutations dans les gènes. En revanche, les 90 pour cent restants sont plus neutres», dit-il, et il poursuit :

« Nous avons donc examiné les mutations dans les parties du génome les moins sensibles à l’environnement. Ces parties indiquent principalement la taille de la population au fil du temps.

Prendre

Dans les montagnes de l’Himalaya vit le Takin. On le trouve dans les forêts de bambous où il se nourrit de feuilles fraîches et d’herbe. Il y a 50 000 ans, la population s’est éteinte. Crédit : Éric Kilby

Le mammouth laineux est un cas atypique

Une grande partie du débat sur les causes de l’extinction ou du déclin des grands animaux s’est concentrée sur le mammouth laineux. Mais c’est un mauvais exemple car la majorité des espèces de mégafaune qui ont disparu étaient associées à des climats tempérés ou tropicaux, comme l’explique Jens-Christian Svenning.

« Les arguments classiques en faveur du climat comme modèle explicatif reposent sur le fait que le mammouth laineux et un certain nombre d’autres espèces associées à ce qu’on appelle la « steppe à mammouths » ont disparu lorsque la glace a fondu et que le type d’habitat a disparu », dit-il. , et continue :

« Il s’agit fondamentalement d’un modèle explicatif insatisfaisant, car la grande majorité des espèces de mégafaune éteintes de l’époque ne vivaient pas du tout dans la steppe mammouth. Ils vivaient dans des régions chaudes, comme les forêts ou les savanes tempérées et tropicales. Dans notre étude, nous montrons également un fort déclin au cours de cette période des populations des nombreuses espèces de mégafaune qui ont survécu et proviennent de toutes sortes de régions et d’habitats différents.

Le point final du débat n’est probablement pas encore fixé, mais Jens-Christian Svenning voit mal comment les arguments en faveur du climat comme explication peuvent continuer.

« Il semble inconcevable qu’il soit possible de proposer un modèle climatique expliquant comment, sur tous les continents et groupes de grands animaux, il y a eu des extinctions et un déclin continu depuis environ 50 000 ans. Et comment cette perte sélective de la mégafaune est unique au cours des 66 derniers millions d’années, malgré l’énorme changement climatique

Compte tenu de la richesse des données dont nous disposons désormais, il est également difficile de nier que cela est dû au fait que les humains se sont répandus à travers le monde depuis l’Afrique et ont ensuite augmenté en population.

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