Une étude de l'UC San Diego a exploré le lien entre les variantes génétiques liées à la consommation d'alcool et des impacts plus larges sur la santé en utilisant les données de 3 millions de participants à 23andMe. Les résultats suggèrent que ces facteurs génétiques sont associés à des effets à la fois protecteurs et néfastes sur la santé. Crédit : Issues.fr.com
L'exploration de 3 millions d'enregistrements révèle des liens entre les variantes génétiques régissant la consommation d'alcool et de nombreuses conditions non liées à l'alcool.
Un groupe de recherche centré sur la faculté de médecine de l'Université de Californie à San Diego a approfondi un ensemble de données de plus de 3 millions d'individus compilé par la société de génétique directe au consommateur 23andMe, Inc., et a découvert des liens fascinants entre les facteurs génétiques influençant la consommation d'alcool. et leur relation avec d'autres troubles.
L'étude a été récemment publiée dans le Lancet eBioMédecine.
Analyse des données génétiques
Sandra Sanchez-Roige, Ph.D., auteur correspondant et professeur agrégé au département de psychiatrie de la faculté de médecine de l'UC San Diego, a expliqué que l'étude utilisait des données génétiques pour classer largement les individus comme étant européens, latino-américains et afro-américains. De telles classifications « sont nécessaires pour éviter un piège de génétique statistique appelé stratification de la population », a noté le co-auteur Abraham A. Palmer, Ph.D., professeur et vice-président de la recherche fondamentale au département de psychiatrie.
Les chercheurs ont analysé les données génétiques des 3 millions de participants à l'étude 23andMe, en se concentrant sur trois petits extraits spécifiques de ADN connus sous le nom de polymorphismes mononucléotidiques, ou SNP. Sanchez-Roige a expliqué que les variantes, ou allèles, de ces SNP particuliers sont « protecteurs » contre une variété de comportements liés à l’alcool, de la consommation excessive d’alcool aux troubles liés à la consommation d’alcool.
Des collaborateurs de l'Université de Californie à San Diego discutent de leur examen d'une base de données 23andMe de 3 millions d'individus. Le groupe comprend (dans le sens des aiguilles d'une montre en partant de la gauche) Abraham A. Palmer, Laura Vilar-Ribo, Renata B. Cupertino, Sandra Sanchez-Roige, Natasia Courchesne-Krak et Mariela V Jennings. Crédit : Sciences de la santé de l’UC San Diego
Variantes génétiques et métabolisme de l'alcool
L'une des variantes de protection contre l'alcool envisagées est très rare : le plus répandu parmi les trois allèles trouvés dans l'étude est apparu chez 232 individus de la cohorte européenne de 2 619 939, 29 des 446 646 de la cohorte latino-américaine et chez 7 des 146 776 afro-américains. cohorte; d'autres sont beaucoup plus courants. Ces variantes affectent la façon dont le corps métabolise l’éthanol – le produit chimique intoxicant présent dans les boissons alcoolisées.
« Les personnes qui possèdent la variante allèle mineure du SNP convertissent très rapidement l’éthanol en acétaldéhyde. Et cela provoque beaucoup d’effets négatifs », a déclaré Sánchez-Roige. Elle a poursuivi en disant que les nausées qui en résultent éclipsent tous les effets agréables de l’alcool – pensez à une mauvaise gueule de bois qui s’installe presque immédiatement.
« Ces variantes sont principalement associées à la quantité d’alcool qu’une personne peut consommer », a-t-elle déclaré. « Et ils ont également tendance à prévenir les troubles liés à la consommation d'alcool, car ces variantes sont principalement associées à la quantité d'alcool qu'une personne peut boire. »
Implications plus larges des variantes génétiques
Sanchez-Roige a expliqué que l'influence des variantes du SNP sur la consommation d'alcool a fait l'objet de nombreuses recherches, mais que son groupe a adopté une approche « sans hypothèse » à l'ensemble de données 23andMe, qui contient des données d'enquête sur des milliers de traits et de comportements. Les chercheurs voulaient savoir si les trois variantes du SNP pourraient avoir d’autres effets que la consommation d’alcool.
Sanchez-Roige et Palmer ont noté que leur groupe a développé un partenariat de 10 ans avec 23andMe qui s'est concentré sur de nombreux traits, en particulier ceux liés à la dépendance. Ce travail est la base d’une collaboration académique à travers le programme de recherche 23andMe.
Ils ont analysé les analyses d'ADN à partir d'échantillons de salive soumis par des participants consentants à l'étude 23andMe, ainsi que les réponses aux enquêtes sur la santé et le comportement disponibles dans la base de données 23andMe, et ont trouvé une constellation d'associations, pas nécessairement liées à l'alcool. Les personnes possédant des allèles protecteurs contre l’alcool étaient généralement en meilleure santé, notamment moins de fatigue chronique et avaient moins besoin d’assistance quotidienne pour les tâches quotidiennes.
Mais l'article note que les individus possédant des allèles protecteurs contre l'alcool présentaient également de moins bons résultats en matière de santé dans certains domaines : plus de tabagisme au cours de la vie, plus d'alimentation émotionnelle, plus de maladie de Basedow et d'hyperthyroïdie. Les individus possédant des allèles protecteurs contre l'alcool ont également signalé des différences totalement inattendues, telles qu'une augmentation du paludisme, de la myopie et de plusieurs cancers, en particulier un plus grand nombre de cancers de la peau et du poumon, ainsi qu'un plus grand nombre de migraines avec aura.
Associations de santé et connaissances génétiques
Sanchez-Roige a reconnu qu'il y avait un aspect de poule et d'œuf dans leurs conclusions. Par exemple : Les maladies cardiovasculaires ne sont qu’une des nombreuses maladies associées à la consommation d’alcool. « Alors, la consommation d’alcool conduit-elle à ces conditions ? elle demande. Palmer conclut sa réflexion : « Ou est-ce que ces différences génétiques influencent des traits comme le paludisme et le cancer de la peau d'une manière indépendante de la consommation d'alcool ?
Sanchez-Roige a déclaré que des études aussi vastes et sans hypothèses ne sont possibles que si les chercheurs ont accès à de très grands ensembles de données. De nombreux ensembles de données, y compris celui utilisé dans l’étude, reposent en grande partie sur des individus d’ascendance européenne.
« Il est important d'inclure des individus issus de différentes origines ancestrales dans les études génétiques, car cela permet une compréhension plus complète des bases génétiques des comportements liés à l'alcool et d'autres conditions, ce qui contribue à une compréhension plus inclusive et plus précise de la santé humaine », a-t-elle déclaré. . « L'étude d'un seul groupe d'individus génétiquement similaires (par exemple, des individus d'ascendance européenne commune) pourrait aggraver les disparités en matière de santé en favorisant des découvertes qui bénéficieront de manière disproportionnée uniquement à cette population. »
Conclusion et orientations futures de la recherche
Elle a déclaré que leur étude ouvre de nombreuses portes pour de futures recherches, recherchant des liens possibles entre les allèles protecteurs de l'alcool et des conditions qui n'ont aucun lien apparent avec la consommation d'alcool.
« Comprendre les mécanismes sous-jacents de ces effets pourrait avoir des implications pour les traitements et la médecine préventive », a noté Sanchez-Roige.
Les co-auteurs de l'article du département de psychiatrie de l'École de médecine de San Diego de l'Université de Californie sont Mariela V. Jennings, Natasia S. Courchesne-Krak, Renata B. Cupertino et Sevim B. Bianchi. Sandra Sanchez-Roige est également associée au Département de médecine, Division de médecine génétique, Université Vanderbilt.
Les autres co-auteurs sont : José Jaime Martínez-Magaña, Département de psychiatrie, Division de génétique humaine, Université de Yale Ecole de Médecine; Laura Vilar-Ribó, Unité de génétique psychiatrique, Groupe de psychiatrie, santé mentale et toxicomanie, Institut de recherche Vall d'Hebron, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelone, Espagne ; Alexander S. Hatoum, Département de psychologie et des sciences du cerveau, Université Washington à St. Louis ; Elizabeth G. Atkinson, Département de génétique moléculaire et humaine, Baylor College of Medicine ; Paola Giusti-Rodriguez, Département de psychiatrie, Université de Floride Faculté de médecine ; Janitza L. Montalvo-Ortiz, Département de psychiatrie, Division de génétique humaine, École de médecine de l'Université de Yale, Centre national du trouble de stress post-traumatique, Centre de santé VA CT ; Joel Gelernter, centre de santé VA CT, département de psychiatrie, West Haven CT ; et départements de psychiatrie, génétique et neurosciences, Yale Univ. Ecole de Médecine; María Soler Artigas, Unité de génétique psychiatrique, Groupe de psychiatrie, santé mentale et toxicomanie, Institut de recherche Vall d'Hebron, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelone, Espagne ; Département de Santé Mentale, Hôpital Universitaire Vall d'Hebron, Barcelone ; Centre de recherche du réseau biomédical sur la santé mentale (CIBERSAM), Madrid ; et Département de génétique, microbiologie et statistiques, Faculté de biologie, Universitat de Barcelona ; Howard J. Edenberg, Département de biochimie et de biologie moléculaire, École de médecine de l'Université d'Indiana ; et l'équipe de recherche de 23andMe Inc., comprenant Sarah L. Elson et Pierre Fontanillas.
L'étude a été financée, en partie, par les subventions T32IR5226 et 28IR-0070 du programme de recherche sur les maladies liées au tabac, l'Institut national de la santé (NIH), l'Institut national de l'abus des drogues (NIDA) DP1DA054394 et l'Institut national de la santé mentale (NIMH) R25MH081482. .
